Los hoteles gays en Mykonos pueden dividirse aproximadamente en dos ubicaciones, dependiendo de si la cercanía a la escena o a la playa es más importante para ti. Si quieres tener la vida nocturna a tu puerta, busca alojamiento en o directamente en las afueras de Chora, porque la mayoría de los bares están alrededor del antiguo puerto y solo se puede llegar a pie. Una casa abiertamente gay en esta ubicación es Axel Beach Mykonos, de la cadena Axel, orientada a la comunidad LGBT. Cerca de la ciudad también hay casas más pequeñas, claramente frecuentadas por personas homosexuales, como la Elena.
La segunda opción está en el sur, cerca de las conocidas playas. Cerca de Elia, la principal playa gay de la isla, hay resorts de lujo, como las casas del grupo Myconian, que no son exclusivamente queer, pero tratan con parejas del mismo sexo como algo habitual. Desde allí puedes llegar rápidamente al agua. Sin embargo, para la vida nocturna en la ciudad, necesitarás un taxi o un autobús, ya que las playas están a unos veinte o treinta minutos de Chora. Planifica con antelación si tu estancia es en temporada alta o en los días de XLSIOR de agosto, porque entonces las casas más codiciadas se llenan rápidamente y los precios son notablemente más altos. La siguiente opción te ayudará a elegir una ubicación y una casa que se adapten a tu estancia.